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AProtLec8MaterialsWS14 in ABI
Learning units Learning unit 8A/B to De novo peptide identification and algorithmic concepts Learning unit 8C to De novo ID with Antilope Learning unit 8D to Comp…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdapterRemoval in ABI
template void remove(StringSet seq, StringSet qual, StringSet const adapter) { Align, ArrayGaps align; resize(rows(align), 2); for …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdvancedAlgorithms in ABI
Page AdvancedAlgorithms This is the Wiki for a project oriented version of P4. Here you can find a StudentList Direct links to topics $ Algorithmic problems …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdvancedAlgorithms11 in ABI
Page AdvancedAlgorithms11 Welcome to the Wiki of the Lecture Advanced Algorithms in Bioinformatics (P4). News * 28.09. (Weese): The second examination (Nachkl…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdvancedAlgorithms11_GenomeRNAComparison in ABI
Genome Comparison and RNA Analysis Lectures Date Lecture* *Materials Genome Comparison 03.06.2011 Segment Match Refinement script 12 MatchRe…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdvancedAlgorithms11_Indices in ABI
Index Data Structures Lectures Date Lecture* *Materials (Enhanced) Suffix Array 09.05.2011 Suffix Array Construction and Searching script 07…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdvancedAlgorithms11_Searching in ABI
Online String Searching and Filtering Lectures Date Lecture* *Materials Online Searching 11.04.2011 Introduction, Horspool, Wu Manber script…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AdvancedAlgorithms12 in ABI
Page AdvancedAlgorithms12 Welcome to the Wiki of the Lecture Advanced Algorithms in Bioinformatics (P4). News * (18.1.13) The results of the second exam can…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AgabiCss in ABI
delete
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10 in ABI
Page AlDaBiWS10 Willkommen im Wiki der Vorlesung
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10CodeReview in ABI
Page AlDaBiWS10CodeReview Tragen Sie sich zu einem der beiden Termine für den Code Review 1 ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Dienstag, 14.12., Arnimallee 6, …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10CodeReview2 in ABI
Page AlDaBiWS10CodeReview2 Tragen Sie sich zu einem der beiden Termine für den Code Review 2 ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Dienstag, 08.02., Arnimallee 6,...
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10Groups in ABI
Page AlDaBiWS10Groups Tragen Sie hier ihre Gruppe mit deren Teilnehmern (voller Name) ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Gruppen Gruppennr. Teilnehmer 1 …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10PResults in ABI
Page AlDaBiWS10PResults ((short description what this page is about)) Section 1 ((content)) Section 2 ((content)) Comments * Punktestand.pdf: Punktestand.pd…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10Praktikum in ABI
Praktikumsvorlesung Hier finden Sie die Termine und Folien der P VL. Zurück zur Veranstaltungsseite. 1. Vorlesung, 22.10. #AnchorVL1 $ Thema: Einführung, Subv…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS10Tutorium in ABI
Page AlDaBiWS10Tutorium Tragen Sie bei Bedarf hier für ein Dienstagstutorium ein. Der Termin 14 16 Uhr ist als Backup gedacht, wenn zum Termin 12 14 Uhr kein Plat…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS11 in ABI
Page AlDaBiWS11 Willkommen im Wiki der Vorlesung
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS11CodeReview in ABI
Die Code Review findet am 13.12.2011 im PC Pool statt. Tragen Sie ihre Gruppe in die Tabelle ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Gruppen Zeit Gruppennr. …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS11CodeReview2 in ABI
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS11Groups in ABI
Tragen Sie hier ihre Gruppe mit deren Teilnehmern (voller Name) ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Gruppen Gruppennr. Teilnehmer 1 Teilnehmer 2 Teilneh…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS11Praktikum in ABI
Praktikumsvorlesung Hier finden Sie die Termine und Folien der P VL. Zurück zur Veranstaltungsseite. 1. Vorlesung, 20.10. #AnchorVL1 $ Thema: Einführung, Subv…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS11Tutorium in ABI
Page AlDaBiWS11Tutorium Tragen Sie bei Bedarf hier für ein Dienstagstutorium ein. Der Termin 14 16 Uhr ist als Backup gedacht, wenn zum Termin 12 14 Uhr kein Plat…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS12 in ABI
Page AlDaBiWS12 Willkommen im Wiki der Vorlesung
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS12CodeReview in ABI
Die Code Review findet am 11.12.2012 im PC Pool statt. Tragen Sie ihre Gruppe in die Tabelle ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Gruppen Gruppe 1 9 …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS12CodeReview2 in ABI
Die Code Review findet am 25.01.2013 im Raum 018 für die Gruppen 1 9 und im Raum 010 für die Gruppen 10 18 statt. Tragen Sie ihre Gruppe in die Tabelle ein. Z…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS12Groups in ABI
Tragen Sie hier ihre Gruppe mit deren Teilnehmern (voller Name) ein. Zurück zur Veranstaltungsseite. Gruppen Gruppennr. Teilnehmer 1 Teilnehmer 2 Teiln…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS12Praktikum in ABI
Praktikumsvorlesung Hier finden Sie die Termine und Folien der P VL. Zurück zur Veranstaltungsseite. 1. Vorlesung, 18.10. #AnchorVL1 $ Thema: Einführung, C , …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS12Tutorium in ABI
Page AlDaBiWS12Tutorium Tragen Sie bei Bedarf hier für ein Dienstagstutorium ein. Der Termin 14 16 Uhr ist als Backup gedacht, wenn zum Termin 12 14 Uhr kein Plat…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS13 in ABI
Page AlDaBiWS13 Willkommen im Wiki der Vorlesung Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik (19700) Die Vorlesung hat 12 credits, davon zählen 6 credits au…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS13CodeReview in ABI
Page AlDaBiWS13CodeReview Tragen Sie hier Ihre Gruppe für einen Time Slot des Code Reviews ein. Stellen Sie sich darauf ein, den Code den ihre Gruppe abgegeben h…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS13Groups in ABI
Tragen Sie hier ihre Gruppe mit deren Teilnehmern (voller Name) ein. Zurück zum Praktikum oder zur Veranstaltungsseite. Gruppen Gruppennr. Teilnehmer 1 Tei…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS13Praktikum in ABI
AlDaBiWS13Praktikum Diese Seite behandelt das Praktikum zu Algorithmen und Datenstrukturen WS13 (hier geht es zur Vorlesungsseite). Übersicht Das Praktikum beste…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS13Tutorium in ABI
Page AlDaBiWS13Tutorium Tragen Sie bei Bedarf hier für ein Praktikumstutorium ein. Der Termin 14 16 Uhr ist als Backup gedacht, wenn zum Termin 12 14 Uhr kein Pla…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS14 in ABI
AlDaBi (WiSe 2014) Willkommen im Wiki der Vorlesung Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik (LV Nr. siehe Orte und Zeiten) Die Vorlesung hat 12 credits,...
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS14CodeReview in ABI
Page AlDaBiWS14CodeReview Tragen Sie hier Ihre Gruppe für einen Time Slot des Code Reviews ein. Es gibt 2 parallele Time slots. Jede Gruppe trägt sich nur in ein…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS14Groups in ABI
Tragen Sie hier ihre Gruppe mit deren Teilnehmern (voller Name) ein. Zurück zum Praktikum oder zur Veranstaltungsseite. Gruppen Gruppennr. Teilnehmer 1 T…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS14Praktikum in ABI
AlDaBiWS14Praktikum Diese Seite behandelt das Praktikum zu Algorithmen und Datenstrukturen WS14 (hier geht es zur Vorlesungsseite). Übersicht Das Praktikum beste…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS14Tutorium in ABI
Page AlDaBiWS14Tutorium Tragen Sie bei Bedarf hier für ein Praktikumstutorium ein. Der Termin 14 16 Uhr ist als Backup gedacht, wenn zum Termin 12 14 Uhr kein Pla…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS15 in ABI
AlDaBiWS15 ((short description what this page is about)) Section 1 ((content)) Section 2 ((content)) Comments
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS15Groups in ABI
Tragen Sie hier ihr Paar mit deren Teilnehmern (voller Name) ein. Zurück zum Praktikum oder zur Veranstaltungsseite. Paare Paarnr. Teilnehmer 1 Teilnehme…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS15Praktikum in ABI
AlDaBiWS15Praktikum Diese Seite behandelt das Praktikum zu Algorithmen und Datenstrukturen WS15. Übersicht Das Praktikum besteht aus: * Praktikumsvorlesung …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlDaBiWS15Tutorium in ABI
Page AlDaBiWS15Tutorium Tragen Sie sich bei Bedarf jeweils in der Woche vor dem Prakikumstutorium hier für ein Praktikumstutorium ein. Der Haupttermin für das Tut…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgBioWS11 in ABI
Page AlgBioWS11 Willkommen im Wiki der Vorlesung Algorithmische Bioinformatik! News Die Einsicht in die Nachklausur findet am Donnerstag den * 3. Mai um 14:0…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture10Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 3, lecture 6/6 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture10MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 3, lecture 5 * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture10MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the third block (lectures 10 and 11). * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture11Materials in ABI
Here is all the material for the lecture 12 * Download the slides
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture12Materials in ABI
Here is all the material for the lecture 12 * Download the slides * Video on Alan Turing at Youtube * Additional material: Characterizing r.e. sets by ge…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture12MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the lecture 12 * Download the slides * Video on Alan Turing
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture13Materials in ABI
Here is all the material for the lecture 13 * Download the slides * Additional material: Turing machine codes and a non r.e. language
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture13MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for turing machines pt. 1. * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture13MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the lecture 13 * Download the slides * Additional material 1 : Turing machines as enumerators * Additional material 2 : Unde…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture14Materials in ABI
Here is all the material for the lecture 14 * Download the slides
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture14MaterialsWS13 in ABI
Here are the materials for turing machines pt. 2 definition of run time analysis. * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture14MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the lecture 14 * Download the slides
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture15Materials in ABI
Here is all the material for the lecture 15 * Download the slides
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture15MaterialsWS13 in ABI
Here are the notes about polynomial reductions, NP, NP completeness and some examples. * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture15MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the lecture 15 * Download the slides
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture16Materials in ABI
Here is all the material for the lecture 16 * Download the slides
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture1Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 1, lecture 1 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture1MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 1, lecture 1 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture1MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the first block (lectures 1 and 2). * Download the lecture notes * Chapter of Motwani book * Review paper by Karp: Randomize…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture2Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 1, lecture 2 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture2MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 1, lecture 2 * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture2MaterialsWS14 in ABI
For the script see lecture 1.
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture3Materials in ABI
Here is all the material for Lecture 3 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.1.1 1.3)
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture3MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 1, lecture 3 * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture3MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for Lecture 3 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.1.1 1.3)
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture4Materials in ABI
Here is all the material for Lecture 4 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.4.2 4.4)
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture4MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 2, lecture 1 * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture4MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for Lecture 4 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.4.2 4.4) * Some history
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture5Materials in ABI
Here is all the material for Lecture 5 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.3.1,3.2,3.4)
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture5MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 2, lecture 2\ For script see previous lecture.
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture5MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for Lecture 5 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.3.1,3.2,3.4)
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture6Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 2, lecture 4/5 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture6MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 3, lecture 1 * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture6MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the third block (lectures 6 and 7). * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture7Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 2, lecture 4/5 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture7MaterialsWS14 in ABI
AlgLecture7MaterialsWS14 ((short description what this page is about)) Section 1 ((content)) Section 2 ((content)) Comments
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture8Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 3, lecture 3/4 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture8MaterialsWS13 in ABI
Here is all the material for the lecture unit 3, lecture 3 * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture8MaterialsWS14 in ABI
Here is all the material for the third block (lectures 8 and 9). * Download the lecture notes
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgLecture9Materials in ABI
Here is all the material for the lecture unit 3, lecture 3/4 * Download the script
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgorithmsProgrammingCodeReview in ABI
The code review takes place on the 28th of November in room 020 in the Takustraße 9. Please, fill in the group number into your desired time slot. Back to program…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgorithmsProgrammingExerciseWS14 in ABI
Please, fill in the names of your group members (given name and surname). Back to programming wiki or to lecture wiki. Gruppen Group No. Member 1 Member …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgorithmsWS12 in ABI
Page AlgorithmsWS12 Welcome to the Wiki of the MSc lectures Algorithms News 27.03.2013: The second exam will be on Monday, April 15th (12 14, Arnimallee 6, SR03…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgorithmsWS13 in ABI
Page AlgorithmsWS13 Welcome to the Wiki of the MSc lectures Algorithms (19712) News Klausureinsicht 2. Prüfung : 30 April 2014, 9 10h, T9, R012 Nachklausur…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlgorithmsWS14 in ABI
Algorithms (WiSe 2014) Welcome to the Wiki of the MSc lectures Algorithms (VL: 19400501, UE: 19400502) News * The results of the second exam are online …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlignmentHeuristics in ABI
Vorlesung Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Skript: * chaining.pdf * filtering.pdf Übungen: Inhalt Datei Material 6. Übung …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlignmentHeuristicsWS11 in ABI
Vorlesung Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Skript: * filtering.pdf * blast filtering.pdf Übungen: Inhalt Datei Material 7. …
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlignmentHeuristicsWS12 in ABI
Page AlignmentHeuristicsWS12 Vorlesung Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Skript: * fasta.pdf * blast filtering.pdf * quasar.pdf Video…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlignmentHeuristicsWS13 in ABI
Page AlignmentHeuristicsWS13 Vorlesung Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Skript: * fasta.pdf * blast.pdf * quasar.pdf Videos: * Vo…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AlignmentHeuristicsWS14 in ABI
Page AlignmentHeuristicsWS14 Vorlesung Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Skript: * fasta * blast * quasar Videos: Hier das Vorl…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AnalysisMethods in ABI
Analysis Methods and algorithm design Lectures Date Lecture* *Materials 19.10.2010 Run time analysis I runtime.pdf 21.10.2010 Run time analys…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AnalysisMethodsWS11 in ABI
Analysis Methods and algorithm design Lectures Date Lecture* *Materials 18.10.2011 Run time analysis I runtime.pdf 20.10.2011 Run time analys…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AsperaDownloads in ABI
AsperaDownloads Aspera is a company that provides the fasp protocol which uses UDP for file transfer and is much faster than FTP over TCP. The protocol is proprie…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AssemblyComparison in ABI
Original goal: 1. Download the reads from a fairly well finished genome Human chr.21 2. and assemble it using two or more standard assemblers e.g. Cel…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AssignmentWeek1 in ABI
General information for programming exercises * Each group gets access to a svn directory at https://svn.mi.fu berlin.de/agbio/advancedAlgo/SS12/GroupX (Groups…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AssignmentWeek2 in ABI
Sign up at ProgrammingGroupList for one of the exercises on Tuesday 15th and Wednesday 16th Exercise 2 Read mapping with QUASAR Deadline: 23.05.2012 9:00 a.m. Im…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
AssignmentWeek3 in ABI
Sign up at ProgrammingGroupList for one of the exercises on Tuesday 12th and Wednesday 14th Exercise 3 Compression with BWT Deadline: 24.06.2012 6:00 p.m. Implem…
09 Aug 2023 - 17:03, UnknownUser
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