Vorlesung

Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Der letzte Abschnitt, "Banded alignment", wird nicht relevant für die Klausur sein.

Skript: pairwise.pdf

Übungen:

Inhalt Datei Material
3. Übung A3.pdf Skript (pairwise.pdf) Sequence-Comparison Kapitel 2 und 3
4. Übung A4.pdf Skript (pairwise.pdf) Sequence-Comparison Kapitel 3
5. Übung A5.pdf Skript (pairwise.pdf)

Hinweis zu Kapitel 3: Beim DP-Algorithmus zu den affinen Gapkosten sind im Skript und im Buch sowohl die Rekursion als auch die Kostenfunktion unterschiedlich definiert. Für die Übung und Klausur sollten die Definitionen aus dem Skript verwendet werden.

-- Main.hartnamn - 09 Nov 2010

 
Topic revision: r12 - 22 Nov 2010, KnutReinert
 
  • Printable version of this topic (p) Printable version of this topic (p)