Vorlesung

Bitte lesen Sie das Skript vor der Vorlesung durch. Der letzte Abschnitt, "Banded alignment", wird nicht relevant für die Klausur sein.

Skript: pairwise.pdf

Übungen:

Inhalt	Datei	Material
5. Übung	A5.pdf	Skript (pairwise.pdf)
4. Übung	A4.pdf	Skript (pairwise.pdf) Sequence-Comparison Kapitel 3
3. Übung	A3.pdf	Skript (pairwise.pdf) Sequence-Comparison Kapitel 2 und 3

Hinweis zu Kapitel 3: Beim DP-Algorithmus zu den affinen Gapkosten sind im Skript und im Buch sowohl die Rekursion als auch die Kostenfunktion unterschiedlich definiert. Für die Übung und Klausur sollten die Definitionen aus dem Skript verwendet werden.

-- Main.hartnamn - 09 Nov 2010