Alle Zeiten sind s.t., also wie außerhalb der Uni zu verstehen.
Zu den unten genannten Terminen (Tutorialwoche und Vorträge) gibt es eine Anwesenheitspflicht.
Die Ausarbeitung des Projektplans und die Bearbeitung der Projekte erfolgt dann selbständig in freier Arbeit mit Unterstützung des Betreuers.
Während dieser Zeit sollten sich die Teilnehmer regelmäßig/wöchentlich mit ihrem Betreuer treffen.
Anmeldung: siehe http://www.mi.fu-berlin.de/bioinf/stud/bachelor/studienablauf/projektmanagement.html
WICHTIG: Wenn ihr auf jeden Fall in unserer AG das Software-Praktikum machen wollt und auch jetzt schon überlegt bei uns Bachelor-Arbeit zu machen, dann meldet euch vor Ablauf der Frist bei uns!! Kontakt: hannes.hauswedell [ät] fu-berlin.de Vorstellungsfolien: 2015_SoSe_SWP.pdfNr. | Name |
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1 | Mona Prendke |
2 | Maximilian Pohl |
3 | Anton Komissarov |
4 | Philip Albrecht |
5 | Angelina Scheck |
6 | Sebastian Proft |
Teilprojekt | StudentIn | BetreuerIn |
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1. SeqAnDemo in Javascript | 2 | Hannes Hauswedell |
2. Assessment of off-target effects of non-coding RNAs | 5 | Jongkyu Kim |
3. Read mapper: Einfacher, exakter read mapper | 4 | Christopher Pockrandt |
4. Vectorized Needleman-Wunsch | 1 | Marcel Ehrhardt |
5. Add BAM support to SeqAn SequenceFile | 3,6 | Temesgen Dadi |
6. Genome sized alignment (LAGAN) | 3,6 | Rene Rahn |
Datum | Termin/Dauer | Name | Ort |
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Di, 29.03.2016 | 10-18Uhr | Vorbesprechung, C++-Schnellkurs, Git, Compiler einrichten | T9/005 |
Mi, 30.03.2016 | 09-18Uhr | SeqAn UGM Day1, Background + Introduction | T9/005 |
Do, 31.03.2016 | 09-16Uhr | SeqAn UGM Day2, Tutorial Sessions | T9/005 |
Do, 31.03.2016 | 16-19Uhr | SeqAn UGM Social Event (freiwillig, kostenpflichtig, evtl. Essen frei) | ?? |
Fr, 01.04.2016 | 09-16Uhr | SeqAn UGM Day3, Tutorial Sessions | T9/005 |
Mo, 04.04.2016 | 10-18Uhr | Nachbesprechung SeqAn UGM, Weitere Tutorials, Aufteilung der Projekte | T9/051 |
selbstständige Arbeit | |||
Mo, 18.04.2016 | 10-12Uhr | Vorstellung der Projektpläne (je 10min + 5min feedback) | A3/119 |
selbstständige Arbeit | |||
Mo, 23.05.2016 | 23:59Uhr | Abgabe des Abschlussberichts | (per Email) |
Mo, 30.05.2016 | 10-18Uhr | Vorstellung der Ergebnisse; 12-14 Uhr Mittagspause | 10-12 T9/049 14-18 A6/031 |
Uhrzeit | Inhalt | Lehrperson |
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15:00 | Pause | |
16:30 | Pause | |
10:00 | Organisatorisches | Hannes |
12:30 | Mittagspause | |
16:45 | Git + GitHub Crashkurs | Chris |
18:00 | Ende | |
13:30 | Debugger Crashkurs | Rene |
15:15 | CMake Crashkurs | Marcel |
10:15 | C++ Crashkurs | Hannes |
Wir unterstützen im Rahmen dieses Praktikums die folgenden Entwicklungsumgebungen / Betriebssysteme.
Windows | Visual Studio 14 (2015), die Community Edition ist kostenlos erhältlich |
Linux | Makefiles mit GCC >= 4.9 oder Clang >= 3.5 |
Mac Os X | Xcode & Makefiles |
sudo port install git cmake python27
sudo apt-get install git cmake python2.7