Aufgabe 5, Gruppe 2 (Melanie): Beschleunigung der FCA aus Aufgabe 3

• das das gleiche tut, wie das in Aufgabe 3 (FCA), nur schneller:
  • Entferne zuerst die blockierten Reaktionen aus dem Netzwerk
  • Finde danach die trivial gekoppelten Reaktionen
  • Setze nicht die Reaktionen in der stöchimetrischen Matrix auf 0, sondern die Bounds des Flussvektors.
  • Vermeide alle unnötigen Kombinationen an Reaktionen (falls der l-te Eintrag von result.x ungleich Null ist, und v_i = 0 gesetzt wurde, kann l nicht gerichtet gekoppelt an i sein.)
  • Ob zwei Reaktionen voll gekoppelt sind, muss nicht extra berechnet werden, dies kann daran abgelesen werden, dass i gerichtet gekoppelt an j ist und das j gerichtet gekoppelt an i ist.
  • Wenn j gerichtet gekoppelt an i ist und l gerichtet gekoppelt an j ist, dann ist auch l gerichtet gekoppelt an i. Dies braucht nicht extra berechnet werden.
  • Erstelle neben dem Programm eine Laufzeitanalyse (des vorherigen Programms und des neuen Programms) für zwei der Netzwerke. Achte desweiteren darauf, dass die gleichen Kopplungen gefunden werden.
    
• Fragt den User des Programms, ob die blockierten Reaktionen des Netzwerks entfernt werden sollen, oder ob dies schon getan wurde.