Aufgabe 2: Flux Coupling Analysis

Deadline: Mittwoch, 25.03.2015

Schreibe ein Programm, dass:

• ein metabolisches Netzwerk einliest: Einen struct in einem .mat file, welches "network" heißt, wie in Aufgabe 1 beschrieben.

Das Programm soll folgendes berechnen:

• für jede Reaktion soll berechnet werden, ob und wenn ja, wie sie zu den anderen Reaktionen gekoppelt ist (gerichtet, voll gekoppelt oder gar nicht)

Ausgabe-Format: Eine Matrix, die aus 0en, 1en und 2en besteht. An der Stelle (i,j) bedeutet eine

• 0, dass die Reaktion i nicht an die Reaktion j gekoppelt ist
• 1, dass die Reaktion i an die Reaktion j voll gekoppelt ist
• 2, dass die Reaktion j an die Reaktion i gerichtet gekoppelt ist

Desweiteren sollen die benötigte Zeit, die Anzahl der voll gekoppelten Reaktionen und die Anzahl der gerichtet gekoppelten Reaktionen ausgegeben werden. (Hierzu: 1 → 2 → 3 werden als zwei gerichtete Kopplungen gezählt, auch wenn noch 1 → 3 gilt. 1 <-> 2 <-> 3 sind 2 volle Kopplungen (1 <-> 3 wird hier wieder ignoriert), aber sollen nicht zu den Gerichteten gezählt werden.)