WiSe 2011/2012

19182: V+Ü Discrete Mathematics for Bioinformatics (P1) (Vorlesung + Übung)
Linear programming; Combinatorial optimization; Graph algorithms; Advanced data structures; Discrete modelling; RNA and protein structure analysis; Molecular evolution.
InstructorKnut Reinert, Prof. Dr. Alexander Bockmayr
Student Profile MSc Bioinformatics students. In the old regulations the lecture counts for Studienbereich C and D. In the new regulations it is module P1.
TimeOct 18, 2010 | 10:00 AM
Lectures: Tue 10-12 Takustr. 9 SR 006   Thu 10-12 Takustr. 9 SR 006 Exercises: Tue   8:30-10   Takustr. 9   SR 006  
19700: Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik (Vorlesung + Übung+Praktikum)
ACHTUNG: Die Kommunikation für die Vorlesung wird in einem Wiki-Bereich stattfinden.   In der Vorlesung werden folgende Inhalte behandelt: Exaktes und approximatives String Matching, Dynamische Programmierung und Scoring Schemata, Endliche Automaten und formale Sprachen, paarweises und multiples Alignment, Multiples String Matching, Grundlagen von Markovketten und Hidden Markov Models, ...
InstructorKnut Reinert, Enrico Siragusa
Student ProfilePflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester.
TimeOct 20, 2010 | 02:00 PM
Vorlesung: Do 14-16 Takustr. 9 SR 005 Übungen: Di 10-12 Arnimallee 7 SR 140   Di 14-16 Takustr. 9 K40   Mi 10-12   Takustr. 9 SR 006 Praktikum: Do (ungerade) 12-14 Takustr. 9 SR 006 Tutorium: Di (gerade) 12-14 Arnimallee 6 SR 017   DI (gerade) 14-16 Arnimallee 6 SR 017  
19710: Algorithmische Bioinformatik (Vorlesung + Übung)
Fortgeschrittene Algorithmen für paarweises und multiples Alignment Praktische Datenbanksuchalgorithmen und Filterverfahren Statistische Signifikanz von Sequenzähnlichkeit und Ergebnissen von Datenbanksuchen Statistische Signalanalyse mittels (hidden) Markov Models, Anwendungen in Mustersuche und Genvorhersage Algorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume ...
InstructorKnut Reinert
TimeOct 17, 2011 | 12:00 PM
Vorlesung: Mo 12-14 Takustr. 9 SR 005   Mi 10-12 Takustr. 9 SR 005 Übungen: Di 10-12  Arnimallee 6 025/026   Di 12-14 Takustr. 9 SR 053   Di 16-18 Takustr. 9 SR 049  
19576b: Journal Club Computational Biology (Seminar)
In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students can participate by giving a talk about their thesis or Forschungspraktikum or (voluntartily) by presenting a paper.
InstructorKnut Reinert
Student ProfileMaster and PhD students in Bioinformatics, Computer Science and Mathematics
TimeOct 17, 2011
Monday 14:00 - 16:00
19576c: Computational Methods for High-Throughput Omics Data (Seminar)
In this seminar, we will focus on two different kinds of high-throughput technologies: second-generation DNA sequencing liquid chromatography / mass spectrometry. In the first part, we will address current computational methods for processing and analysing DNA sequencing data. In particular, we will focus on methods for the detection of genomic variation, i.e. differences between ...
InstructorKnut Reinert, Chris Bielow, Anne-Katrin Emde
TimeOct 18, 2011 | 02:00 PM
Dienstag 14 - 16 Uhr Vorbesprechung am 18.10. !
19615: Programmierkurs C/C++ (Blockkurs)
(Blockkurs) Die Veranstaltung gibt eine Einführung in die Programmiersprache C/C++ für Studierende, die bereits über Grundkenntnisse einer imperativen Programmiersprache (wie z.B. Java) verfügen. Die Lehrinhalte werden durch Rechnerübungen vertieft.
Student ProfileStudierende der Informatik oder Bioinformatik.
TimeOct 10, 2011 - Oct 14, 2011
Seminar: Mo-Fr 10-12 Arnimallee 3 HS 001 Übungen Mo-Fr 13-15 Takustrasse 9 K46, K48    Mo-Fr 15-17 Takustrasse 9 K46, K48