Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik

Die Vorlesung gibt eine Einführung in grundlegende algorithmische Techniken und Datenstrukturen für Strings und Graphen. Dabei stehen bioinformatische Fragestellungen im Vordergrund.

(19700)

TypeVorlesung + Übung+Praktikum
InstructorKnut Reinert, David Weese
Homepagehttps://www.mi.fu-berlin.de/w/ABI/AlDaBiWS10
Credit Points12
StartOct 01, 2010 | 02:00 PM
Time

Vorlesung:

Do

14-16

Takustr. 9

SR 005

Übungen:

Di

10-12

Arnimallee 7

SR 140

 

Di

 14-16  

Arnimallee 6

007/008

 

Mi

10-12

  Takustr. 9

SR 055

Praktikum:

Fr

10-12

Takustr. 9

SR 006

Tutorium:

Di

12-14

Arnimallee 6

SR 017

 

DI

14-16

Arnimallee 6

SR 017

 

Student Profile

Pflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester. Achtung: Diese Vorlesung wird dieses Jahr mit 12 statt 6 credits stattfinden, da wir davon ausgehen, dass alle Studenten in die neue Studienordnung wechseln werden. Studenten die dies nicht tun, brauchen das Praktikum nicht abzuleisten.

Literature

Generelle Bücher:

  • Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8
  • R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3
  •  David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7
  • Chao, Zhang: Sequence comparison, Theory and Methods: Springer, ISBN: 978-1-85800-319-4

mehr im Wiki.

ACHTUNG: Die Kommunikation für die Vorlesung wird in einem Wiki-Bereich stattfinden. Bitte klicken Sie hier. Insbesondere werden wir von Ihnen Vorarbeiten verlangen. Für Sie beginnt die Vorlesung somit am 1.10.2010.