Algorithmen in der Systembiologie (Bockmayr, Vingron)
(4+2 SWS)
Pflichtveranstaltung nach neuer Studienordnung

V/Ü

10

A/B/D
Pflicht

Advanced Algorithms in Bioinformatics (Reinert)
(4+2 SWS)
Pflichtveranstaltung nach neuer Studienordnung

V/Ü

10

C/D
Pflicht

Didaktik der Informatik (Schulte, Knobelsdorf)
(1+2 SWS)

V/S/P

1+2

-

Journal Club Computational Biology (Reinert)
(2 SWS)

S

3

C/D

Verteiltes Rechnen und Parallelprogrammierung (Schütte, Conrad)
(2 SWS)

S

3

C/D
(A/B)¹

Kommunikation im Nervensystem
(1 SWS)

S

2

A

Medizinische Bioinformatik: Beiträge zur Immunoinformatik
(2 SWS)

S

4

A/B

Multiscale Modelling, Analysis, and Numerics
(4+2 SWS)

V/Ü

10

k.A.

Onkogene, Viren und Tumorsuppressorgene und Intervention durch Gentherapie
Block (Fr 6.6. und Sa 7.6. jeweils 15.15-19.00)

V/S

1

B/C

Methoden zur Identifizierung von Spleißstellen und Genen (Genannotation)
(4+4 SWS)

S/Ü

8

C/D

Modellierung biologischer Wachstums- und Adaptationsvorgänge A
(3 SWS)

V/S

6

A/B

Modellierung biologischer Wachstums- und Adaptationsvorgänge B
(2 SWS)

S

4

A/B

Medizinische Bildverarbeitung
(2 SWS)

V

3

D

Bildgebende Verfahren in der Medizin
(2 SWS)

V

3

A/B/C/D

Pathophysiologie A
(1 SWS)

S

2

A/B

Pathophysiologie B
(1 SWS)

S

2

A/B

Fortgeschrittene Methoden in der Simulation von Biomolekülen
(2 SWS)

S

4

B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere
(1 SWS)

V/Ü

2

A/B

Stochastische Prozesse
(2+1 SWS)

V/Ü

4+2

C

Messung und Analyse biologischer Prozesse A
(3 SWS)

V/S

6

k.A.

Messung und Analyse biologischer Prozesse B
(2 SWS)

S

4

k.A.

Künstliche Intelligenz
(2+2 SWS)

V/Ü

5

A/D

Forschungsseminar Künstliche Intelligenz
(2 SWS)

S

4

A/D

Discrete Mathematics for Bioinformatics (Klau, Larhlimi)
(4+2 SWS)
Pflichtveranstaltung nach neuer Studienordnung

V/Ü

10

C/D
Pflicht

Numerical methods for odes and numerical linear algebra (Numerik II)
(4+2 SWS)
Pflichtveranstaltung nach neuer Studienordnung

V/Ü

10

B/D
Pflicht

Systembiologie/Medizin
(8 SWS)
Pflichtveranstaltung nach neuer Studienordnung

V/S/P

5+5

A/B/D
Pflicht

Scientific Visualization
(4+2 SWS)

V/Ü

10

D

Kommunikation im Nervensystem
(1 SWS)

S

2

A

Medizinische Bioinformatik: Beiträge zur Immunoinformatik II
(2 SWS)

S

4

A/B

Mustererkennung
(2+2 SWS)

V/Ü

6

A/C/D

Onkogene, Viren und Tumorsuppressorgene und Intervention durch Gentherapie
Block (dreitägig 15.-17. Juni 2007)

V/S

1

B/C

Methoden zum schnellen Vergleich von Sequenzen (Sequenzvergleiche)
(2+2 SWS)

S/Ü

4

C/D

Population Genetics
(3 SWS)

V/Ü

4

C/D

Introduction to DNA methylation and its impact on gene regulation
(3 SWS)

V/S

4

A

Probability and Statistics for Sequence Analysis
(2+2 SWS)

V/Ü

6

C/D

Medizinische Bildverarbeitung
(2 SWS)

V

3

D

Bildgebende Verfahren in der Medizin
(2 SWS)

V

3

A/B/C/D

Time Series Analysis
(2+2 SWS)

S

6

B/C/D

Pathophysiologie I
(1 SWS)

S

4

A/B

Simulation von Biomolekülen
(2+2 SWS)

V/Ü

6

B

Metabolic networks
(2 SWS)

S

4

A/D

Proteomics
(2 SWS)

S

3

C/D

Journal Club Computational Biology
(2 SWS)

S

3

C/D

Algorithmen in der Systembiologie
(P3) (2+2 SWS)

V/Ü

6

A/B/D

Gute Ideen in der theoretischen Biologie / Systembiologie
(Teil von "Algorithmen in der Systembiologie")
(P3) (2 SWS)
dienstags 16:00-18:00, SR 051, Takustraße 9. (ab 17.04.)

S

4

A/B/D

Advanced Algorithms in Bioinformatics: Sequence and Structure Analysis
(P4) (6 SWS)

V/Ü

10

C/D

Kommunikation im Nervensystem
(1 SWS)

S

2

A

Medizinische Bioinformatik: Beiträge zur Immunoinformatik
(2 SWS)

S

4

A/B

Methoden zur Identifizierung von Spleißstellen und Genen (Genannotation)
(4+2 SWS)

S/Ü

8

C/D

Onkogene, Viren und Tumorsuppressorgene und Intervention durch Gentherapie
Block (dreitägig 15.-17. Juni 2007)

V/S

1

B/C

Seminar on Evolutionary Genomics - The Evolution of Sex Chromosomes
(2 SWS)

S

4

C/D

Seminar zu aktuellen Themen der Bionformatik
(2 SWS)

S

4

A/C/D

Künstliche Intelligenz
(2+2 SWS)

V/Ü

6

A/D

Visualisierung in Naturwissenschaft und Technik
(2+2 SWS)

V/Ü

6

D

Medizinische Bildverarbeitung
(2 SWS)

V

3

D

Bildgebende Verfahren in der Medizin
(2 SWS)

V

3

A/B/C/D

Genexpression und -regulation
(2 SWS)

S

4

C

Pathophysiologie
(1 SWS)

S

2

A/B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere
(1 SWS)

V/Ü

2

A/B

Journal Club Computational Biology
(2 SWS)

S

4

C/D

Angewandte Biometrie
(4 SWS)

V/S/P

5

A/B/D

RNA: Algorithms for secondary structure and gene detection
(2 SWS)

V

5

B/C

Mathematik des Hörens
(2 SWS)

S

5

A/B

Grundlagen der molekularen Evolution
(1 SWS)

S

2

C/D

S

5

B/C

Diskrete Mathematik
(P1) (4+2 SWS)

V/Ü

10

C/D

Basic Course Numerical methods for ODEs and numerical linear algebra (Numerik II)
(AM) (4+2 SWS)

V/Ü

10

B/D

Systembiologie / Medizin (APS und Biometrie)
(P6) (8 SWS)

V/S/P

(5+5)

A/B/D

Sequenzanalyse und molekulare Evolution
(W2 B) (1, N) (2 SWS)

S

4

C/D

Grundlagen der molekularen Evolution
(1 SWS)

S

2

C/D

Vertiefung Statistischer Methoden in Genetik und Bioinformatik
(W10 B) (2 SWS)

V/Ü

6

C/D

Einführung in Scientific Visualization
(AM) (2+2 SWS)

V/Ü

6

D

Journal Club Computational Biology (Master and PhD students)
(N) (2 SWS)

S

3

C/D

Kommunikation im Nervensystem
(1 SWS)

S

2

A

Mustererkennung
(1, 2, N) (2+2 SWS)

V/Ü

6

A/C/D

Otto Warburg International Summer School and Workshop on Evolutionary Genomics
(2 SWS) (Englisch)

S

4

A/B

Theoretical Evolutionary Genetics
(2+1+2 SWS)

V/Ü/P

4+4

B/C/D

Medizinische Bioinformatik: Beiträge zur Immunoinformatik
(2 SWS)

S

4

A/B

Automatische Annotationen von Genen
(2 SWS)

S

4

C/D

Mathematical systems biology
(AM) (2 SWS)

S

4

A

Methoden zum schnellen Vergleich von Sequenzen (Sequenzvergleiche)
(2+2 SWS)

S/Ü

4

C/D

Mathematische Modellierung von Stoffwechselprozessen, Signaltransduktion und Genexpression
(2 SWS)

V

4

A/B

Systembiologie II: Gestalt, Dynamik und Funktion von biochemischen Netzwerken
(2 SWS)

V

3

A

Sequence analysis II

V/Ü

6

C/D

Seminar über Proteomics

S

3

C

Journal Club Computational Biology

S

3

C/D

Logical methods in biology

V/Ü

6

A/C

Bildverarbeitung

V/Ü

6

C/D

Künstliche Intelligenz

V/Ü

6

A

Bildgebende Verfahren in der Medizin

V

3

D

Algorithms for the reconstruction of phylogeny

S

4

B/C

Analyse Physiologischer Signale

V

7

A/B/D

Pathophysiologie II

S

2

A/B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere

V

2

A/B

Biometrie

V/P

5

A/B/D

Visualisierung molekularer Mechanismen

S/P

5

D

Modellierung biologischer Wachstums- und Adaptationsvorgänge

S/Ü

5

A/B

3D-Bildgebung und Geometriekonstruktion in der Biologie

P/S

5

A/D

FP Experimente, Analysen, Simulationen: Von der Datenerhebung zum Modell in der experimentellen Neurobiologie für Bioinformatiker

P/S

5

A

Regulation der Genexpression durch Onkogene und Viren und Intervention durch Gentherapie

V/S

2

B/C

Medizinische Bioinformatik : Beiträge zur Immunoinformatik

S

4

A/B

Kommunikation im Nervensystem

S

2

A

Evolution genregulatorischer Sequenzen in Wirbeltieren

P

9

C/D

Bioinformatische Verfahren zum Studium der Genregulation

S

3

C/D

Selected Topics in Computational Neuroscience

S

2

A

Journal Club Theoretical Neuroscience

S

1

A

Grundlagen der molekularen Evolution

S

2

C/D

Methoden zur Identifizierung von Spleißstellen und Genen (Genannotation)

S/Ü

8

C/D

Modellierung und Datenintegration in der Systembiologie

V

2

A/B

Medizinische Relevanz des alternativen Spleißens

S

4

A/C/D

Fortgeschrittene mathematische Aspekte der Bioinformatik, Diskrete Mathematik

V/Ü

10

C/D

Journal Club Computational Biology

S

4

C/D

Hybrid Systems in Biology

V/Ü

6

A/C

Einführung in Scientific Visualization

V/Ü

10

D

Modellierung und Simulation in Medizin und Biologie

P/S

5

A/B

Mustererkennung

V/Ü

6

C/D

Bildgebende Verfahren in der Medizin

V

3

D

Mathematische Modellierung von Stoffwechselprozessen und Genexpression

V

3

A/B

Genexpressionsanalyse

V/Ü

9

C/D

Algorithms for the computation of phylogenetic trees

V/Ü

6

B/C

Introduction to Computational Neuroscience and Neuroinformatics

V/Ü

6

A

Neurobiology (Learning and Memory, Biochemistry, Neurophysiology, Behavior, Development)

V

2

A

Seminar für Fortgeschrittene: Neurobiology (Learning and Memory, Biochemistry, Neurophysiology, Behavior, Development)

S

3

A

Model Systems in Neurobiology: from Molecules to Behavior

V

2

A

Seminar für Fortgeschrittene: Model Systems in Neurobiology: from Molecules to Behavior

S

3

A

Medizinische Bioinformatik II : Vom Peptid zur Leitstruktur

S

4

B

Kommunikation im Nervensystem

S

2

A

Angewandtes Data Mining

P

5

C/D

Evolutionary Genomics Seminar

S

4

B/C

Analyse Physiologischer Signale

V

7

A/B/D

Biometrie

V/S/P

5

A/B/D

Pathophysiologie I

S

2

A/B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere

V/Ü

2

A/B

Methoden zum schnellen Vergleich von Sequenzen (Sequenzvergleiche)

S/Ü

8

C/D

Algebraic Statistics

S

5

C/D

Wie Zellen denken: Struktur und Funktion von Regulationsnetzen

S

4

A/B

Genotypisierung und Proteinnachweis im Organismus

S/P

5

B/C

Modellierung biologischer Wachstums- und Adaptationsvorgänge

S/Ü

5

A/B

Sequence analysis II

V/Ü

6

C/D

Fortgeschrittenes C++

V

3

C/D

Journal Club Computational Biology

S

4

C/D

Statistical Methods in Bioinformatics

S

5

C/D

Kontinuierliche Markov Ketten und ihre Anwendungen (Markov Ketten II)

V

4

A/B

Der lange Weg zum Wirkstoff

S

5

A/B/C/D

Fortgeschrittene Methoden in der Molekulardynamik

S

4

B

Moleküle im Rechner

S

keine

B

Qualitative modeling and analysis of biological networks

V+Ü

6

A

Mathematical programming in structural biology

S

4

B

Evolution eukaryontischer Promotorsequenzen

P+S

12

C/D

Information theoretic methods in bioinformatics

S

5

C/D

Implementing information theoretic methods in bioinformatics

P

5

C/D

Analyse Physiologischer Signale

V

7

A/B/D

Pathophysiologie II

S

2

A/B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere

V

2

A/B

Biometrie

V

5

A/B/D

Transkriptionelle Regulation - Theorie und Methoden

V/S

4

A/C

Otto Warburg International Summer School and Workshop on Networks and Regulation

S

4

A/B

Techniken des Molecular Modeling

P

5

B/D

Medizinische Bioinformatik I: Vom Peptid zur Leitstruktur

S

4

B

Regulation der Genexpression durch Onkogene und Viren und Intervention durch Gentherapie

V/S

2

B/C

Kommunikation im Nervensystem

S

2

A

Im Reich der Sinne: Sinneswelten der Tiere und des Menschen

V

3

A

How the Nervous System Develops

V+S

3

A

3D-Bildgebung und Geometriekonstruktion in der Biologie für Biologen und Bioinformatiker

P/S

5

A/D

FP Experimente, Analysen, Simulationen: Von der Datenerhebung zum Modell in der experimentellen Neurobiologie für Bioinformatiker

P/S

5

A

Concepts in Neuroinformatics: Functional Connectivity  Schwerpunkt

P/S

4

A

Aktuelle Problematik des alternativen Spleißens

S

4

C

Analyse von Genannotationen

S/Ü

4+3

C/D

Einführung in die funktionelle Genomforschung

V/S

5

B/C

Computer Graphics / Computer Vision

V/Ü

7

D

Von der Evolution zu den Methoden des evolutiven Drug Design

V

3

B

Anwendungen und spezielle Themen in Data Mining

S

3

D

Einführung in die künstliche Intelligenz

V/Ü

6

A/D

Sequence analysis I

V/Ü

6

C/D

Phylogenetics

S

5

C/D

Genome Comparison

S

4

C/D

Modelling and Simulation in Medicine, Biology and Biotechnology

V/P

5

A/B

Einführung in die Theorie der Markovketten

V

4

A/B

Simulation von Biomolekülen

V/Ü

6

B

Molekulare Bioinformatik: Konzepte für das virtuelle Wirkstoffdesign II

S

3

B/C

Kommunikation im Nervensystem

S

2

A

Regulation der Genexpression durch Onkogene und Viren..

V/S

2

B/C

Computer simulation of biomolecules

V/P

7

B

Model Systems in Neurobiology

V/S

5

A

Neurobiology

V/S

5

A

Concepts in Neuroinformatics

S

4

A

APS (Analyse physiologischer Signale)

V/Ü

7

A/B/D

Pathophysiologie

S

2

A/B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere

V

2

A/B

Biometrie

V/P

3

A/B/D

Grundlagen der molekularen Evolution

S

2

C/D

Genotypisierung und Proteinnachweis im Organismus

P

5

B/C

Biological Networks

S

3

A

Transkriptionelle Regulation - Theorie und Methoden

V/S

4

A/C/D

Mathematische Modellierung von Stoffwechselprozessen und Genexpression

V

3

A/B

Bioinformatische Verfahren zum Sequenzvergleich

V/Ü

6

C/D

Bildgebende Verfahren in der Medizin

V

3

D

Data Mining & Prediction

S

3

C/D

Einführung in Scientific Visulization

V/Ü

7

D

Journal Club Computational Biology

S

4

C/D

Advanced sequence analysis

V/Ü

6+9

C/D

Combinatorial Optimization in Computational Biology

S

4

C/D

Proteomics

S

4

C/D

Der lange Weg zum Wirkstoff

S

5

A-D

Pharmakokinetische Fallstudien

S

5

A/B

Mathematische Modellierung und Simulation in der Medizin und Biotechnologie

V/S

5

A/B

Simulation von Biomolekülen

V/Ü

6

B

New concepts and techniques in Neuroscience

V

3

A

Vom Verhalten zum Gehirn - Die neuronalen Grundlagen des Verhaltens

V

3

A

3D-Bildgebung und Geometriekonstruktion in der Biologie...

P

5

A/D

Von der Datenerhebung zum Modell in der experimentellen Neurobiologie

P/S

5

A

Introduction to Computational Neuroscience and Neuroinformatics

V/Ü

6

A

Sehen und Riechen

V/S

3

A

Molekulare Bioinformatik: Konzepte für das virtuelle Wirkstoffdesign I

S

3

B/C

Kommunikation im Nervensystem

S

2

A

Regulation der Genexpression durch Onkogene und Viren..

V/S

2

B/C

Analyse von DNA-Microarrays

P/S

9+3

C/D

Statistische Mustererkennung mit Hidden-Markov-Modellen

V

3

C/D

Statistische Gruppentests

S

5

C/D

Angewandte Optimierung

S

4

B

Analyse physiologischer Signale

V/Ü

6

A

Pathophysiologie

S

2

A/B

Schlüsseltechnologien bei der Untersuchung der epithelialen Barriere

V/Ü

2

A/B

Gene Prediction and Drug Design

S

3

C

Navigationsalgorithmen für medizinische Anwendungen

S

4

B/D

Computational Neuroscience IV

V/Ü

5

A/D

Einführung in die künstliche Intelligenz

V/Ü

6

A/D

XML-Technologies

V/Ü

6

C

Markovketten, Vorlesung

V

3

B

Markovketten, Seminar

S

3

B

*Hamiltonsche Systeme und klassische Moleküldynamik

V/Ü

6

B

Bayes'sche Netzwerke

S

3

A

Externe Algorithmen und Datenstrukturen

V/Ü

6

C/D

Algorithmen zur Analyse von 2DE-Gelbildern

S

3

D

Molekulare Bioinformatik: Konzepte für das virtuelle Wirkstoffdesign

S

3

B/C

*Kommunikation im Nervensystem

S

2

A

*Regulation der Genexpression durch Onkogene und Viren..

V/S

2

B/C

3D-Bildgebung und Geometrierekonstruktion in der Biologie für Bioinformatiker

P/S

5

D

*Networks in Brains (Model Systems)

V/S

6

A

*Neurobiology

V/S

6

A

Modellierung biologischer Wachstums- und Adaptationsvorgänge

Ü

5

A

Neurovegetative Regulation

V/Ü

4

A

*Biometrie I

V

2

A

*Mathematische Modellierung von Stoffwechselprozessen und Genexpression

V

3

A/B

Von der Datenerhebung zum Modell in der expermintellen Neurobiologie

P/S

5

A

(*)Analyse physiologischer Signale

V/Ü

6

A

Vom Verhalten zum Gehirn

V

4

A

Introduction to Computational Neuroscience and Neuroinformatics

V/Ü

6

A

New Concepts and Techniques in the Neuroscience

V

4

A

Statistische Mustererkennung in der Bioinformatik

V

3

C/D

Sequenzvergleich

S

3

C

Neuronale Netze

V/Ü

6

A

Fortgeschrittene Aspekte zur Sequenzanalyse

V/Ü

6

C

Swarm Intelligence

S

3

A

Genomvergleich

S

3

C

Proteomics

S

3

C

Modellierung dynamischer Prozesse in der Zellbiologie

S

3

A/B

(*)Molecular Modelling on Workstations

V/Ü

6

B

*Moleküle im Rechner

S

3

B

*Elements of Statistical Learning

S

4

C/D

*Principles of Population Genetics

S

3

C

*Datenbanksysteme II

V/Ü

8

C

*Seminar über Algorithmen

S

4

C/D

*Pharmakokinetik

S

5

A/B

*Algorithmen für Stochastik und Stochastik für Algorithmen

V/Ü

6

C

*Verarbeitung von Microarray-Daten

V/Ü

9

C/D

*Nachbearbeitung RECOMB 2003

S

4

C/D

*Clusteranalyse heterogener Daten

S

5

C/D

*Angewandtes Data Mining

P

5

C/D

*Wirkstoffdesign II

S

3

B/C

*Concepts in Neuroinformatics

S

4

A

*Sensory Physiology

V/S

4

A

*DNA- und Proteinsequenzvergleiche

V/Ü

6

C

*Theoretische Immunologie (HU, Inst. f. Biologie)/Theoret. Immunologie

V/Ü

4

A/B

*Evolutionäre Spieltheorie und Evolutionsgenetik (HU, Inst. f. Biologie, ITB)/Evolutionsgenetik

V/Ü

4

A/B

*Computerpraktikum C++ zu Evolutionäre Spieltheorie und Evolutionsgenetik (HU, Inst. f. Biologie, ITB)/Prakt. Evolutionsgenetik

P

4

A/B

*Modelle zur Informationsverarbeitung im Gehirn (TU, Fak. IV)/Infoverarb. Gehirn

V

6

A

*Neuronale Informationsverarbeitung: I Überwachte Verfahren (TU, Fak. IV)/Neuronale Info I

V/Ü

9

A/D

Neuronale Informationsverarbeitung: II Unüberwachte Verfahren (TU, Fak. IV)/Neuronale Info II

V/Ü

9

A/D