SeqAn
Titel: Algorithmen zur Analyse von von genomischen Sequenz-Daten (SeqAn)
Dozent(en): K. Reinert
Maximale Teilnehmerzahl: 6
Zeitraum/Vorbesprechungstermin:
x.03. – x.03. Einführende Seminarwoche, ganztägig
x.03. – x.04. eigenständiges Arbeiten mit wöchentlichen Treffen bzw. nach Absprache
x.03. Vorstellung Arbeits/Projektplan
x.04. Abschlusspräsentation
In Ausnahmefällen kann nach Rücksprache mit der betreuenden Person der Arbeitszeitraum auch angepasst werden (bspw. gebuchter Urlaub in Semesterferien).
Ort: Institut für Informatik
Kurze inhaltliche Beschreibung:
Implementierung von Algorithmen für die Sequenzanalyse genomischer (Massen)daten & Erstellen kleinerer Analysepipelines mit Hilfe einer bestehenden C++-Bibliothek. Dabei sollen neben dem Programmieren auch Elemente des Software-Engineering eingeübt werden (Erstellen eines Zeitplanes, Benutzung von Programmierwerkzeugen, Erstellen von Tests, Arbeiten im Team, etc.)
Quantitative Aufteilung:
Praktische Programmierarbeit: 60%
Soft Skills: 40%
Verwendete Programmiersprache(n): C++
Schwierigkeitsgrad (Acht Sterne verteilt auf drei Bereiche):
A Programmieren: *****
B Biologie/Chemie: *
C Projektmanagement: **
Unbedingt erforderliche Vorkenntnisse: C++
Kontaktadresse, Webseite:
