DozentIn(en): S. Andreotti, Ch. Bielow

Maximale Teilnehmerzahl: 6

Zeitraum/Vorbesprechungstermin:

Ort: Institut für Informatik

Kurze inhaltliche Beschreibung:

In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Analyse von Massenspektrometrie Daten implementiert, und zwar im Rahmen der Software-Bibliothek OpenMS, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird. Mithilfe der zu implementierenden Module werden komplexe Analyse-Pipelines für Proteom/Metabolom Daten in KNIME realisiert.

Quantitative Aufteilung (in %):

Praktische Programmierarbeit: 60%
Soft Skills: 40%

Verwendete Programmiersprache(n): C++

Schwierigkeitsgrad (Acht Sterne verteilt auf drei Bereiche):

A Programmieren: 4*
B Biologie/Chemie: 1*
C Projektmanagement: 3*

Erforderliche Vorkenntnisse: gute Kenntnisse in C/C++

Kontaktadresse, Webseite/Link:

http://www.bsc.fu-berlin.de/TeachingAndWorkshops/SoSe18/Software_Praktikum_OpenMS/index.html

Präsentation:

http://www.bsc.fu-berlin.de/TeachingAndWorkshops/SoSe19/Software_Praktikum_OpenMS/SWP-OpenMS-_-Vorstellung.pdf