Praxismodule Applied Sequence Analysis
Welcome to the Wiki of the Praxisseminar Applied Sequence AnalysisNews
Times and rooms
Rooms and timings
| Event | Day | Time | Address | Room |
|---|---|---|---|---|
| Modul | Wednesday | 10-14 | Arnimallee 6 | R 017 |
Schedule
| Date | Lecture |
|---|---|
| 10.04.-24.04. | Big Data (Tim Conrad) |
| 08.05.-29.05. | Parallel Computing (Tim Conrad) |
| 05.06.-12.06. | The SeqAn C++ library (Knut Reinert) |
| 19.06.-10.07. | Workflow engines (Knut Reinert) |
Material
- Anand Rajaraman and Jeffrey D. Ullman. Mining of Massive Datasets Cambridge University Press, 2011.
- Hadoop book
- Examples from Hadoop book
Requirements for Aktive Teilnahme
Course details
- Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten können Standardprogramme im Bereich der Sequenzanalyse selbstständig benutzen. Sie kennen die verschiedenen Konzepte und sind in der Lage, ausgewählte Systeme zu bedienen und zu programmieren. Die Studentinnen und Studenten können neue Workflows konzipieren und die Ergebnisse grafisch aufbereiten.
- Inhalte: Es werden vertieft Themen aus folgenden Gebieten behandelt:
- Implementierungen von verteiltem Rechnen
- Einbinden von Standardprogrammen in Workflows
- Erstellen und Anwenden von Bioinformatik Workflows in bestehenden Systemen
- Zeitaufwand
- 15 Wochen
- SWS: 4h
- Präsenzzeit: 60h
- Vor- und Nachbereitung: 70h
- Prüfungsvorbereitung und Prüfung: 20h
This topic: ABI > WebHome > LectureWiki > Projektseminar_Advanced_Sequence_Analysis_2013
Topic revision: 30 May 2013, aiche
Topic revision: 30 May 2013, aiche
Copyright © by the contributing authors. All material on this collaboration platform is the property of the contributing authors. Ideas, requests, problems regarding Foswiki? Send feedback