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MolnetzASS16_2
Exercise 2: Flux Coupling Analysis and a reducing tool Deadline: Tuesday, 31.05.2016, 08:00 a.m. FCA Write a program that: * reads in a metabolic network: a...
r8 - 30 May 2016 - 08:29 by AnnikaRoehl
SoftWareProjectSS16
Welcome to the Seminar Wiki Projektmanagement im Softwarebereich: Regulatorische Netzwerke SS 2016 News Präsentationen: Die Präsentationen finden am Montag, den...
MolnetzASS16_1
Exercise 1: Flux Balance Analysis and Flux Variability Analysis Deadline: Tuesday, 17.05.2016, 08:00 a.m. FBA Write a program that: * reads in a metabolic ne...
r2 - 17 May 2016 - 09:18 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15
Aufgaben Hier findet ihr die Programmieraufgaben und evtl. zugehörige Materialien. Um den zip file mit den Netzwerken zu downloaden, klickt hier. Hier ein paar ...
r16 - 25 Apr 2016 - 12:11 by AnnikaRoehl
MolnetzASS14
Welcome to the Lectures Wiki Metabolic Networks SS 2014 News General information SWS: 3, ECTS: 5 Lecturer: Alexander Bockmayr / Annika Röhl Language: English / ...
r35 - 19 Apr 2016 - 13:47 by AnnikaRoehl
OptLecture15MaterialsWS15
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AlgorithmsProgrammingCodeReview
The code review takes place on the 22nd of February in room 010 in the Takustraße 9. Please, fill in the group number into your desired time slot. Back to program...
ProgrammingExercisesWS15
General information for programming exercises * Please, fill in the names of your group members here, before the programming exercises start. * Each group g...
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OptLecture1MaterialsWS15
Here is all the material for the lecture 1 * Download the slides * Additional material: Kolman/Beck, Linear programming, Chap.1.3 1.4 (click on pdf)
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Here is all the material for the lecture 13 * Download the slides * Additional material 1 : Turing machines as enumerators * Additional material 2 : Unde...
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Here is all the material for the lecture 12 * Download the slides * Video on Alan Turing Comments
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AlgLecture10MaterialsWS15 ((Tree decomposition)) Lecture plan Outline of lecture Comments
AlgLecture8MaterialsWS15
AlgLecture8MaterialsWS15 ((Skip lists part 1)) Lecture plan Outline of lecture Comments
AlgorithmsProgrammingExerciseWS15
Please, send the name (given name and surname) and zedat login name of your three group members to Christopher Pockrandt via e mail. As soon as you your name appe...
AlgLecture6MaterialsWS15
AlgLecture6MaterialsWS15 ((Hashing and modulo arithmetic part 1)) Lecture plan Outline of lecture Update: supplementary notes accompanying the prime arithmetic ...
AlgLecture7MaterialsWS15
AlgLecture7MaterialsWS15 ((Hashing part 2)) Lecture plan Outline of lecture Comments
AlgLecture5MaterialsWS15
Here is all the material for Lecture 5 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.3.1,3.2,3.4) * Some history: Jack...
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Here is all the material for Lecture 4 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.4.2 4.4) * Some history Comments...
AlgLecture3MaterialsWS15
Here is all the material for Lecture 3 * Download slides * Download lecture notes by A. Schrijver, CWI Amsterdam (Chap.1.1 1.3)
AlgLecture2MaterialsWS15
AlgLecture2MaterialsWS15 ((Basic runtime analysis part 2)) Lecture plan Outline of lecture Comments
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AlgLecture1MaterialsWS15 ((Introduction, types of algorithms, and basic runtime analysis part 1)) Lecture plan Outline of lecture Comments
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MolnetzASS15
Welcome to the Lectures Wiki Metabolic Networks SS 2015 News General information SWS: 2 1, ECTS: 5 Lecturer: Alexander Bockmayr Tutor: Therese Lorenz Language:...
SoftWareProjectSS15
Welcome to the Seminar Wiki Projektmanagement im Softwarebereich: Metabolische Netzwerke SS 2015 News Am Dienstag den 26.05.2015 findet um 10:15 in 017/A6 der Ab...
r21 - 07 Jul 2015 - 10:33 by AnnikaRoehl
ProAnalysisSS15
Willkommen beim Wiki "Proseminar zur Analysis", SS 2015 Ankündigungen Allgemeine Information Im Proseminar werden wir uns mit Themen aus dem Bereich der mathem...
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_6_1
Aufgabe 6, Gruppe 1: Beschleunigung der Berechnung der elementaren Flussmoden Deadline: Mittwoch, 15.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches ...
r3 - 28 May 2015 - 13:10 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_5_2
Aufgabe 5, Gruppe 2 (Melanie): Beschleunigung der FCA aus Aufgabe 3 Deadline: Mittwoch, 08.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * das das gleiche tut, wie das...
r6 - 28 May 2015 - 13:09 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_1a
Aufgabe 1a: Blocked modus beschleunigen Deadline: Mittwoch, 25.03.2015 Versuche den Blocked Modus aus Programm 1 zu beschleunigen. Tip: Wenn ich über eine Reakt...
r2 - 28 May 2015 - 13:08 by AnnikaRoehl
NetzWerkSS14
Welcome to the Lectures Wiki Netzwerkanalyse SS 2014 News Mündliche Prüfungen: Freitag, 18. Juli 2014, ab 8.00 Uhr, R 142, A6 (Dienstzimmer Bockmayr) G...
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_7
Aufgabe 7: Kopplungen von Metaboliten Deadline: Mittwoch, 22.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Netzwerk einliest: Einen struct in einem...
r2 - 16 Apr 2015 - 13:18 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_6_2
Aufgabe 6, Gruppe 2: Berechnung von essenziellen Reaktionen Deadline: Mittwoch, 15.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Netzwerk einliest:...
r3 - 14 Apr 2015 - 09:09 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_6_3
Aufgabe 6, Gruppe 3: Toolbox zur Untersuchung von metabolischen Netzwerken Deadline: Mittwoch, 15.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Net...
NEW - 09 Apr 2015 - 15:12 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_6_4
Aufgabe 6, Gruppe 4: Minimale Anzahl von Reaktionen, maximales Wachstum Deadline: Mittwoch, 15.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Netzwe...
NEW - 09 Apr 2015 - 15:07 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_5_1
Aufgabe 5, Gruppe 1 (Hanna und Micha): Berechnung der Elementaren Flussmoden Deadline: Mittwoch, 08.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches N...
r4 - 07 Apr 2015 - 08:50 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_5_4
Aufgabe 5, Gruppe 4 (Kateryna): Einlesen eines SBML Files Deadline: Mittwoch, 08.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein xml File einliest, welches im SBML...
r4 - 07 Apr 2015 - 08:50 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_5_3
Aufgabe 5, Gruppe 3 (Mathias): Erstellung von Hassediagrammen Deadline: Mittwoch, 08.04.2015 Schreibe ein Programm, dass: * das den Output der FCA benutzt und...
r3 - 07 Apr 2015 - 08:49 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_2
Aufgabe 2: Flux Coupling Analysis Deadline: Mittwoch, 25.03.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Netzwerk einliest: Einen struct in einem .ma...
r2 - 07 Apr 2015 - 08:39 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_4_2
Aufgabe 4, Gruppe 2: Berechnung Elementarer Flussmoden mithilfe des Algorithmus von de Figueiredo Deadline: Dienstag, 31.03.2015 Bereitet einen 45 minütigen Vort...
r2 - 30 Mar 2015 - 15:05 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_4_1
Aufgabe 4, Gruppe 1: Gemischt Ganzzahlige Optimierung (Mixed Integer Program) Deadline: Dienstag, 31.03.2015 Bereitet einen 45 minütigen Vortrag für Montag, den ...
NEW - 30 Mar 2015 - 13:18 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_3
Aufgabe 3: Flux Variability Analysis Deadline: Mittwoch, 25.03.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Netzwerk einliest: Einen struct in einem ...
NEW - 30 Mar 2015 - 13:16 by AnnikaRoehl
ProgrammingExerciseSoftwareSS15_1
Aufgabe 1: Flux Balance Analysis Deadline: Sonntag, 15.03.2015 Schreibe ein Programm, dass: * ein metabolisches Netzwerk einliest: Einen struct in einem .mat...
NEW - 30 Mar 2015 - 13:08 by AnnikaRoehl
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Topic revision: r3 - 15 Nov 2006, ProjectContributor
 
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