Progress "Schnelle Blastsuche durch Datenbank-Clustering"
Projektplan
| Datum | Wer | Ziel | erreicht |
|---|---|---|---|
| 01.05. | Hannes | GScore mit LocalAlignEnum für cluster und search | ja |
| 01.05. | Jakob | Systemtests für empty Files | ja |
| 03.05. | Hannes | erstes GSearch | ja |
| 03.05. | Jakob | erstes GCluster | ja |
| 03.05. | Jakob & Hannes | Testrahmen | später |
| 10.05. | Jakob | vernünftiges QGram-Scoring | ja |
| 10.05. | Hannes | Verbesserter LocalAlignEnum-Algorithmus | cancelled |
| 10.05. | Hannes | GlobalAlign-Algorithmus | ja |
| 15.05. 14pm | Hannes | computeSensSpec | ja |
| 15.05. 14pm | Jakob | refactoring (alles in app) | nein |
| 15.05. 14pm | Jakob | manueller Test gegen unclustered möglich | ja |
| 17.05. 10:30 | Jakob | automatischer benchmarking Test gegen unclustered | ja |
| 17.05. 10:30 | Jakob | Hinzufügen eines vernünftigen Thresholds für unclustered GSearch | ja |
| 17.05. 10:30 | Hannes | Normalisierung des Scores | cancelled |
| 17.05. 10:30 | Jakob & Hannes | Modultests | später |
| 17.05. | Jakob & Hannes | Testrahmen (ohne alle Modultests) | ja |
| 17.05. | Jakob & Hannes | vollständige Implementation + Tests | später |
| 21.05. | Jakob & Hannes | Manual + Help | später |
| 20.05. | Jakob & Hannes | vollständige Implementation | ja |
| 21.05. | Jakob & Hannes | vollständige Implementation + Tests | ja |
| 22.05. | Hannes | Manual | ja |
| 22.05. | Jakob | Help | ja |
| 24.05. | Jakob & Hannes | Application note | |
| 24.05. | Jakob & Hannes | Projektverlauf | |
| ?????? | ?????? | getKMerSimilarity-Aufruf für alle Sequenzen gleichzeitig | |
| ?????? | ?????? | Jeden Cluster über threshold untersuchen | |
| ?????? | ?????? | Q-Gram Size als Command line parameter übergeben |
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