Projektmanagement im Softwarebereich - OpenMS

In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Analyse von Massenspektrometrie Daten implementiert, und zwar im Rahmen der Software-Bibliothek OpenMS, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird. Mithilfe der zu implementierenden Module werden komplexe Analyse-Pipelines für Proteom/Metabolom Daten in KNIME realisiert. 

Gute Kenntnisse in C/C++ werden vorausgesetzt.

(19403413)

Type

Softwarepraktikum

Instructor

Sandro Andreotti, Chris Bielow

Registration Mode

Die Praktikumsplätze werden über ein besonderes Anmeldeverfahren vergeben. Beachten Sie dazu die Hinweise auf der Webseite des Studienbüros zum Softwarepraktikum.

Allgemein

Zu den unten genannten Terminen (Tutorialwoche und Vorträge) gibt es eine Anwesenheitspflicht. Die Ausarbeitung des Projektplans und die Bearbeitung der Projekte erfolgt dann selbständig in freier Arbeit mit Unterstützung des Betreuers.

Während dieser Zeit sollten sich die Teilnehmer regelmäßig/wöchentlich mit ihrem Betreuer treffen.

Voraussetzungen

  • Erfahrung in ObjektorienPerter Programmierung (Java, C++, ...) 
  • C++ Kenntnisse empfehlenswert (keine Templates) 
  • R Grundwissen (ggplot2) empfehlenswert

Zeitplan

Datum Termin/Dauer Ort Inhalt
 1.3.  10 -12  T9 / 055   Vorbesprechung
20.3. - 24.3. 9 - 12 A6 / SR-007 Tutorials
 ... ... ...  Ausarbeitung der Projektpläne (selbstständig)
 5.4.  9 - 12 T9 / 053  Vorstellung der Projektpläne
7.4. - 5.5. Freitags
10 - 12

T9 / 005 (7.4. - 14.4.)

T9 / 006 (21.4. - 5.5.)

Wöchentliche Treffen begleitend zur selbstständigen Programmierarbeit und Anfertigung des Berichts

12.5. 9 - 18  T9 / K40  Vorstellung der Ergebnisse

Ressourcen

Projektvorstellung

C++

OpenMS

KNIME