Algorithmic Bioinformatics

Realigning sequence reads

Academic Advisor: David Weese , Knut Reinert
Discipline: Bioinformatik
Degree: Master of Science (M.Sc.)
Project:
Status: not assigned

Abstract

Gegeben ist eine Menge von sequenzierten Reads mit zugehörigen paarweisen lokalen Alignments zu einem Referenzgenom. In dieser Arbeit soll die Idee des ReAligner-Algorithmus von Anson und Myers verwendet werden, um die paarweisen Alignments zu multiplen Alignments zwischen Reads und Genom zu erweitern und Konsensus-Strukturen zu berechnen.

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tbd.