Algorithmic Bioinformatics

WiSe 2011/2012

19182: V+Ü Discrete Mathematics for Bioinformatics (P1) (Vorlesung + Übung)
Linear programming; Combinatorial optimization; Graph algorithms; Advanced data structures; Discrete modelling; RNA and protein structure analysis; Molecular evolution.
Instructor Knut Reinert, Prof. Dr. Alexander Bockmayr, Sandro Andreotti
Student Profile MSc Bioinformatics students. In the old regulations the lecture counts for Studienbereich C and D. In the new regulations it is module P1.
Time Oct 18, 2010 | 10:00 AM, Lectures: Tue 10-12 Takustr. 9 SR 006   Thu 10-12 Takustr. 9 SR 006 Exercises: Tue   8:30-10   Takustr. 9   SR 006  
19700: Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik (Vorlesung + Übung+Praktikum)
ACHTUNG: Die Kommunikation für die Vorlesung wird in einem Wiki-Bereich stattfinden.   In der Vorlesung werden folgende Inhalte behandelt: Exaktes und approximatives String Matching, Dynamische Programmierung und Scoring Schemata, Endliche ...
Instructor Knut Reinert, Enrico Siragusa
Student Profile Pflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester.
Time Oct 20, 2010 | 02:00 PM, Vorlesung: Do 14-16 Takustr. 9 SR 005 Übungen: Di 10-12 Arnimallee 7 SR 140   Di 14-16 Takustr. 9 K40   Mi 10-12   Takustr. 9 SR 006 Praktikum: Do (ungerade) 12-14 Takustr. 9 SR 006 Tutorium: Di (gerade) 12-14 Arnimallee 6 SR 017   DI (gerade) 14-16 Arnimallee 6 SR 017  
19710: Algorithmische Bioinformatik (Vorlesung + Übung)
Fortgeschrittene Algorithmen für paarweises und multiples Alignment Praktische Datenbanksuchalgorithmen und Filterverfahren Statistische Signifikanz von Sequenzähnlichkeit und Ergebnissen von Datenbanksuchen Statistische ...
Instructor Knut Reinert
Time Oct 17, 2011 | 12:00 PM, Vorlesung: Mo 12-14 Takustr. 9 SR 005   Mi 10-12 Takustr. 9 SR 005 Übungen: Di 10-12  Arnimallee 6 025/026   Di 12-14 Takustr. 9 SR 053   Di 16-18 Takustr. 9 SR 049  
19576b: Journal Club Computational Biology (Seminar)
In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students can participate by giving a talk about their thesis or Forschungspraktikum or (voluntartily) by presenting a paper.
Instructor Knut Reinert
Student Profile Master and PhD students in Bioinformatics, Computer Science and Mathematics
Time Oct 17, 2011, Monday 14:00 - 16:00
19576c: Computational Methods for High-Throughput Omics Data (Seminar)
In this seminar, we will focus on two different kinds of high-throughput technologies: second-generation DNA sequencing liquid chromatography / mass spectrometry. In the first part, we will address current computational methods for ...
Instructor Knut Reinert, Chris Bielow, Anne-Katrin Emde
Time Oct 18, 2011 | 02:00 PM, Dienstag 14 - 16 Uhr Vorbesprechung am 18.10. !
19615: Programmierkurs C/C++ (Blockkurs)
(Blockkurs) Die Veranstaltung gibt eine Einführung in die Programmiersprache C/C++ für Studierende, die bereits über Grundkenntnisse einer imperativen Programmiersprache (wie z.B. Java) verfügen. Die Lehrinhalte werden durch Rechnerübungen ...
Instructor Sandro Andreotti
Student Profile Studierende der Informatik oder Bioinformatik.
Time Oct 10, 2011 - Oct 14, 2011, Seminar: Mo-Fr 10-12 Arnimallee 3 HS 001 Übungen Mo-Fr 13-15 Takustrasse 9 K46, K48    Mo-Fr 15-17 Takustrasse 9 K46, K48