Algorithmic Bioinformatics

WiSe 2010/2011

19081: V+Ü Discrete Mathematics for Bioinformatics (P1) (Vorlesung + Übung)
Linear programming; Combinatorial optimization; Graph algorithms; Advanced data structures; Discrete modelling; RNA and protein structure analysis; Molecular evolution.
Instructor Knut Reinert, Prof. Dr. Alexander Bockmayr, Sandro Andreotti
Student Profile MSc students of Bioinformatics: In the new "Studienordnung": Pflichtmodul P4.
Time Oct 19, 2010 | 10:00 AM, Lectures: Tue 10-12 Takustr. 9 SR 006   Thu 10-12 Takustr. 9 SR 006 Exercises: Mon   12-14     Takustr. 9   SR 046  
19700: Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik (Vorlesung + Übung+Praktikum)
Die Vorlesung gibt eine Einführung in grundlegende algorithmische Techniken und Datenstrukturen für Strings und Graphen. Dabei stehen bioinformatische Fragestellungen im Vordergrund.
Instructor Knut Reinert, David Weese
Student Profile Pflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester. Achtung: Diese Vorlesung wird dieses Jahr mit 12 statt 6 credits stattfinden, da wir davon ausgehen, dass alle Studenten in die neue Studienordnung wechseln werden. Studenten die dies nicht tun, brauchen das Praktikum nicht abzuleisten.
Time Oct 01, 2010 | 02:00 PM, Vorlesung: Do 14-16 Takustr. 9 SR 005 Übungen: Di 10-12 Arnimallee 7 SR 140   Di  14-16   Arnimallee 6 007/008   Mi 10-12   Takustr. 9 SR 055 Praktikum: Fr 10-12 Takustr. 9 SR 006 Tutorium: Di 12-14 Arnimallee 6 SR 017   DI 14-16 Arnimallee 6 SR 017  
19576: Journal Club Computational Biology (Seminar)
In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students can participate by giving a talk about their thesis or Forschungspraktikum or (voluntartily) by presenting a paper.
Instructor Knut Reinert
Student Profile Master and PhD students in Bioinformatics, Computer Science and Mathematics
Time Monday 10:15 - 11:45
19615: Programmierkurs C/C++ (Blockkurs)
(Blockkurs) Die Veranstaltung gibt eine Einführung in die Programmiersprache C/C++ für Studierende, die bereits über Grundkenntnisse einer imperativen Programmiersprache (wie z.B. Java) verfügen. Die Lehrinhalte werden durch Rechnerübungen ...
Instructor Sandro Andreotti
Student Profile Studierende der Informatik oder Bioinformatik.
Time Oct 11, 2010 - Oct 15, 2010, Seminar: Mo-Fr 10-12 Arnimallee 3 HS 001 Übungen Mo-Fr 13-15 Takustrasse 9 K36, K38, K48    Mo-Fr 15-17 Takustrasse 9 K36, K38, K48  
Projektmanagement im Softwarebereich - Block-VL (Einführungsvorlesung)
An fünf Terminen im Wintersemester finden jeweils 14 Uhr Veranstaltungen als Vorbereitung auf das eigentliche Softwarepraktikum statt. Weitere Informationen finden Sie im Wiki.
Instructor Knut Reinert, David Weese
Time Montag 14-16 Uhr 08.11.2010 Einführung Softwareengineering Reinert 22.11.2010 Programmierwerkzeuge und Umgebungen Weese 06.12.2010 Konzepte der Parallelprogrammierung Conrad 10.01.2011 Anwendung von Datenbanken, Theorie Voisard 17.01.2011 Anwendung von Datenbanken, Praxis Voisard