Algorithmic Bioinformatics

Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik

Die Vorlesung gibt eine Einführung in grundlegende algorithmische Techniken und Datenstrukturen für Strings und Graphen. Dabei stehen bioinformatische Fragestellungen im Vordergrund.

(19700)

Type

Vorlesung + Übung+Praktikum

Instructor

Knut Reinert, David Weese

Homepage

https://www.mi.fu-berlin.de/w/ABI/AlDaBiWS10

Credit Points

12

Time

Vorlesung:
Do
14-16
Takustr. 9
SR 005
Übungen:
Di
10-12
Arnimallee 7
SR 140
 
Di
 14-16  
Arnimallee 6
007/008
 
Mi
10-12
  Takustr. 9
SR 055
Praktikum:
Fr
10-12
Takustr. 9
SR 006
Tutorium:
Di
12-14
Arnimallee 6
SR 017
 
DI
14-16
Arnimallee 6
SR 017

 

Start

Oct 01, 2010 | 02:00 PM

Student Profile

Pflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester.

Achtung: Diese Vorlesung wird dieses Jahr mit 12 statt 6 credits stattfinden, da wir davon ausgehen, dass alle Studenten in die neue Studienordnung wechseln werden. Studenten die dies nicht tun, brauchen das Praktikum nicht abzuleisten.

Literature

Generelle Bücher:

  • Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8
  • R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3
  •  David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7
  • Chao, Zhang: Sequence comparison, Theory and Methods: Springer, ISBN: 978-1-85800-319-4

mehr im Wiki.

ACHTUNG: Die Kommunikation für die Vorlesung wird in einem Wiki-Bereich stattfinden.

Bitte klicken Sie hier. Insbesondere werden wir von Ihnen Vorarbeiten verlangen. Für Sie beginnt die Vorlesung somit am 1.10.2010.